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Desde hace casi 10 años, numerosos proyectos de seguimiento pesquero han vinculado a CLS con esta organización intergubernamental integrada por cinco países del suroeste del Océano Índico (Francia/Isla de la Reunión, Unión de las Comoras, Madagascar, Mauricio y Seychelles).

En 2006 CLS estableció ya en nombre de la COI un centro de seguimiento pesquero THEMIS en Moroni, Islas Comoras. La presencia de CLS en esta subregión se ha consolidado así mismo con el equipamiento del centro de las Seychelles (THEMIS) y el seguimiento de las embarcaciones de pesca (VMS) de Madagascar, Comoras, Mauricio y Francia/Isla de la Reunión. La COI ha renovado, pues, su confianza en CLS y en enero de 2014 le confió la puesta en marcha de un centro regional de seguimiento pesquero que se establecerá en la sede de la organización en Mauricio.

Dicho centro permitirá a las autoridades locales realizar el seguimiento de las actividades de más de 1000 barcos de pesca. El contrato prevé así mismo la actualización del centro de seguimiento pesquero de Madagascar. Tras la celebración de contratos para luchar contra la pesca ilegal en el entorno de las Islas Kerguelen, Heard y Mc Donald, el establecimiento de la estación de adquisición de imágenes por satélite de alta resolución SEAS-OI o también el equipamiento de cientos de barcos locales con balizas de localización, este contrato confirmará a CLS como un colaborador privilegiado en la cuenca índica.